O AT ABA é o profissional que terá uma das funções mais importantes na equipe multidisciplinar, muitas vezes assumindo a maior parte da carga horária do paciente. Ele será o responsável por aplicar protocolos elaborados especificamente para cada paciente, focando em desenvolver inúmeras habilidades faltes ou mesmo reduzir ou extinguir barreiras que comprometem o desenvolvimento do indivíduo autista no seu dia a dia.

Ele trabalhará em questões como a comunicação, comportamentos sociais, o processo de aprendizagem ou mesmo comportamentos agressivos ou inadequados por algum motivo. Para isso, ele estudará a função de cada comportamento, ou seja, ele deverá olhar para os comportamentos aplicados ao dia a dia e analisar o que mantem um comportamento inadequado ocorrendo ou por que um comportamento importante não se desenvolveu e irá intervir de forma que altere as condições para esses comportamentos sejam readequados.